Virtuelle maskiner og PDF: Fremtidens fortidslevninger

Hvis vi bruker dem for reproduserbarhet i dag, vil folk måtte hacke verktøy for å utvinne innholdet deres i morgen. Faktisk ble både virtuelle maskiner og PDF designet for et svært spesifikt formål, men det formålet er ikke vitenskapelig publisering.

PDF ble designet for å fange det eksakte innholdet i trykte papirsider i en datamaskinfil. Det finnes selvsagt veldig gode grunner til dette, og derfor ble PDF så populært. Virtuelle maskiner ble designet for å gjøre en komplett programvarestabel, fra operativsystem til applikasjonsprogramvare, overførbar fra én fysisk datamaskin til en annen. Også her finnes det veldig gode grunner, noe som forklarer hvorfor virtuelle maskiner ble populære.

Både PDF og virtuelle maskiner ble tatt i bruk innen vitenskapelig publisering av ren bekvemmelighet: de var veletablerte teknologier som syntes å svare på et umiddelbart behov. PDF erstattet trykt papir som publiseringsmedium for vitenskap i det som var en minimal overgang til elektronisk publisering: kun mediet ble byttet ut. Men elektronisk publisering kunne muliggjort mye mer: rådata og beregningsmetoder kunne vært maskinlesbare og dermed gjenbrukbare for andre.

Verdt en titt: Coursera Plus — Ett abonnement for universitetsstøttede Python- og datavitenskapelige sertifikater.

Virtuelle maskiner gir en lavterskel måte å arkivere og publisere beregninger på, helt uten endringer i programvaren og filformatene vi bruker i dag. Men igjen går en stor mulighet tapt for å gjøre det bedre, og gjøre data og kildekode tilgjengelige og gjenbrukbare. ActivePapers ble spesielt designet for å løse disse problemene, og er kanskje det første filformatet som har behovene innen vitenskapelig publisering som sin høyeste prioritet.

En ActivePaper kombinerer datasett og koden som bearbeider dem, på en måte som tillater gjenbruk av enten det ene eller det andre (eller begge, selvfølgelig) på en fullt sporbar måte. For å drive vitenskap ikke bare reproduserbart, men også åpent, er dette svært viktig. kommentarer drevet av Disqus

Mer å lese

• Virtuell maskin — Wikipedia